加州理工學院 | 加州理工學院的WormBase和基因組資源項目聯盟被命名為全球核心生物數據資源
指南者留學
2023-01-11 21:10:47
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<p>全球生物數據聯盟(GBC)是一個國際資助者聯盟,今天宣布了第一份全球核心生物數據資源(GCBRs)名單,其中包括37種資源,這些資源的長期資助和可持續(xù)性對全球生命科學和生物醫(yī)學研究至關重要。其中兩個,WormBase和基因組資源聯盟是由加州理工學院領導的。</p>
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<p>布倫大學生物學教授保羅·斯特恩伯格說:“這是向國際社會努力開發(fā)這些全球使用但只在當地資助的項目邁出的巨大第一步。”“這也很好地證明了我們一直在為研究人員提供信息。”</p>
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<p>WormBase是加州理工學院領導的多機構合作項目,旨在向全世界免費提供線蟲或蛔蟲的遺傳信息。據認為,地球上生活著多達100萬種線蟲,其中許多是破壞作物和傳播疾病的害蟲或寄生蟲。它們還碰巧分享了許多人類的基因。因此,世界各地的實驗室都在對這種蠕動的生物進行深入研究。</p>
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<p>WormBase項目始于2000年,最初的目標是創(chuàng)建一個與研究最廣泛的線蟲——模式生物秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditis elegans)相關的在線知識庫。該項目的網站(<a href="www.wormbase.org">www.wormbase.org</a>)現在擁有50多種線蟲物種的基因組數據以及大量的其他實驗數據。每年大約有1200篇科學論文被添加到這個可搜索的數據庫中。目前已有1000多個實驗室注冊為用戶,WormBase是生物醫(yī)學和農業(yè)研究界的寶貴工具。</p>
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<p>基因組資源聯盟開發(fā)和維護可持續(xù)的基因組信息資源,促進利用不同的模式生物來了解人類生物學、健康和疾病的遺傳和基因組基礎。這種理解對于推進基因組生物學研究和將人類基因組數據轉化為臨床應用是至關重要的。通過實施共享的模塊化信息系統(tǒng)架構,該聯盟尋求為不同的用戶群體提供服務,包括希望獲得同源人類基因的所有模型生物數據的人類遺傳學家;基礎科學研究人員,他們使用特定的模式生物來了解基礎生物學;以及計算生物學家和數據科學家,他們需要獲得標準化的、結構良好的數據。</p>
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<p>該聯盟包括多個數據庫,包括FlyBase、小鼠基因組數據庫、大鼠基因組數據庫、酵母基因組數據庫、WormBase、Xenbase、斑馬魚信息網絡和基因本體聯盟。</p>
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<p>加州理工學院參與這兩個項目的研究人員包括Valerio Arnaboldi、Juancarlos Chan (BS '00)、Wen Chen (PhD '00)、Jae Hyoung Cho、Christian Grove、Ranjana Kishore、Raymond Lee、Nicholas Markarian、Jane Mendel、Hans-Michael Muller (PhD '99)、Cecilia Nakamura、Daniela Raciti、Gary Schindelman、Kimberly Van Auken、Qinghua Wang和Karen Yook。</p>
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<p>“就像生態(tài)系統(tǒng)中的關鍵物種一樣,gcbr代表著全球生命科學數據基礎設施中最關鍵的組成部分或節(jié)點,它們的失敗將對全球研究工作產生關鍵影響。”GBC的新聞稿說。“gcbr的一個關鍵特性是,它們所持有的數據是公開的,全世界的研究人員都可以不受限制地訪問和使用。”</p>
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<p>注:本文由院校官方新聞直譯,僅供參考,不代表指南者留學態(tài)度觀點。</p>
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