加州理工學(xué)院 | 加州理工學(xué)院的WormBase和基因組資源項目聯(lián)盟被命名為全球核心生物數(shù)據(jù)資源
指南者留學(xué)
2023-01-11 21:10:47
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<p>全球生物數(shù)據(jù)聯(lián)盟(GBC)是一個國際資助者聯(lián)盟,今天宣布了第一份全球核心生物數(shù)據(jù)資源(GCBRs)名單,其中包括37種資源,這些資源的長期資助和可持續(xù)性對全球生命科學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究至關(guān)重要。其中兩個,WormBase和基因組資源聯(lián)盟是由加州理工學(xué)院領(lǐng)導(dǎo)的。</p>
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<p>布倫大學(xué)生物學(xué)教授保羅·斯特恩伯格說:“這是向國際社會努力開發(fā)這些全球使用但只在當(dāng)?shù)刭Y助的項目邁出的巨大第一步。”“這也很好地證明了我們一直在為研究人員提供信息。”</p>
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<p>WormBase是加州理工學(xué)院領(lǐng)導(dǎo)的多機構(gòu)合作項目,旨在向全世界免費提供線蟲或蛔蟲的遺傳信息。據(jù)認(rèn)為,地球上生活著多達(dá)100萬種線蟲,其中許多是破壞作物和傳播疾病的害蟲或寄生蟲。它們還碰巧分享了許多人類的基因。因此,世界各地的實驗室都在對這種蠕動的生物進(jìn)行深入研究。</p>
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<p>WormBase項目始于2000年,最初的目標(biāo)是創(chuàng)建一個與研究最廣泛的線蟲——模式生物秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditis elegans)相關(guān)的在線知識庫。該項目的網(wǎng)站(<a href="www.wormbase.org">www.wormbase.org</a>)現(xiàn)在擁有50多種線蟲物種的基因組數(shù)據(jù)以及大量的其他實驗數(shù)據(jù)。每年大約有1200篇科學(xué)論文被添加到這個可搜索的數(shù)據(jù)庫中。目前已有1000多個實驗室注冊為用戶,WormBase是生物醫(yī)學(xué)和農(nóng)業(yè)研究界的寶貴工具。</p>
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<p>基因組資源聯(lián)盟開發(fā)和維護(hù)可持續(xù)的基因組信息資源,促進(jìn)利用不同的模式生物來了解人類生物學(xué)、健康和疾病的遺傳和基因組基礎(chǔ)。這種理解對于推進(jìn)基因組生物學(xué)研究和將人類基因組數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為臨床應(yīng)用是至關(guān)重要的。通過實施共享的模塊化信息系統(tǒng)架構(gòu),該聯(lián)盟尋求為不同的用戶群體提供服務(wù),包括希望獲得同源人類基因的所有模型生物數(shù)據(jù)的人類遺傳學(xué)家;基礎(chǔ)科學(xué)研究人員,他們使用特定的模式生物來了解基礎(chǔ)生物學(xué);以及計算生物學(xué)家和數(shù)據(jù)科學(xué)家,他們需要獲得標(biāo)準(zhǔn)化的、結(jié)構(gòu)良好的數(shù)據(jù)。</p>
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<p>該聯(lián)盟包括多個數(shù)據(jù)庫,包括FlyBase、小鼠基因組數(shù)據(jù)庫、大鼠基因組數(shù)據(jù)庫、酵母基因組數(shù)據(jù)庫、WormBase、Xenbase、斑馬魚信息網(wǎng)絡(luò)和基因本體聯(lián)盟。</p>
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<p>加州理工學(xué)院參與這兩個項目的研究人員包括Valerio Arnaboldi、Juancarlos Chan (BS '00)、Wen Chen (PhD '00)、Jae Hyoung Cho、Christian Grove、Ranjana Kishore、Raymond Lee、Nicholas Markarian、Jane Mendel、Hans-Michael Muller (PhD '99)、Cecilia Nakamura、Daniela Raciti、Gary Schindelman、Kimberly Van Auken、Qinghua Wang和Karen Yook。</p>
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<p>“就像生態(tài)系統(tǒng)中的關(guān)鍵物種一樣,gcbr代表著全球生命科學(xué)數(shù)據(jù)基礎(chǔ)設(shè)施中最關(guān)鍵的組成部分或節(jié)點,它們的失敗將對全球研究工作產(chǎn)生關(guān)鍵影響。”GBC的新聞稿說。“gcbr的一個關(guān)鍵特性是,它們所持有的數(shù)據(jù)是公開的,全世界的研究人員都可以不受限制地訪問和使用。”</p>
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<p>注:本文由院校官方新聞直譯,僅供參考,不代表指南者留學(xué)態(tài)度觀點。</p>
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