佐治亞理工學(xué)院 | 創(chuàng)造性破壞:威廉姆斯實(shí)驗(yàn)室探索蛋白質(zhì)的進(jìn)化
指南者留學(xué)
2023-03-17 09:08:52
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<p>蛋白質(zhì)的存在時(shí)間比我們長(zhǎng)得多——作為生物進(jìn)化的基石,我們的存在依賴于它們?,F(xiàn)在,佐治亞理工學(xué)院的研究人員正在申請(qǐng)20第個(gè)-研究蛋白質(zhì)如何進(jìn)化的世紀(jì)理論概念,它可能會(huì)導(dǎo)致人類最古老的問(wèn)題之一的答案:我們是如何成為我們的?</p>
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<p>在一個(gè)典型的人類細(xì)胞內(nèi)有成千上萬(wàn)的蛋白質(zhì)。我們需要如此之多的蛋白質(zhì),因?yàn)榈鞍踪|(zhì)是細(xì)胞的熟練勞動(dòng)力,每個(gè)蛋白質(zhì)都執(zhí)行特定的工作。有些可以使肌肉細(xì)胞或神經(jīng)元更加堅(jiān)固。其他分子與特定的靶向分子結(jié)合,將其運(yùn)送到新的位置。此外,還有其他激活細(xì)胞分裂和生長(zhǎng)過(guò)程的物質(zhì)。</p>
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<p>蛋白質(zhì)的特定功能取決于其形狀,為了實(shí)現(xiàn)其功能形狀,即天然狀態(tài),蛋白質(zhì)折疊。蛋白質(zhì)以長(zhǎng)鏈氨基酸的形式開始生命,稱為多肽。氨基酸的序列決定了蛋白質(zhì)鏈如何折疊并形成一個(gè)復(fù)雜的3D結(jié)構(gòu),使蛋白質(zhì)能夠執(zhí)行預(yù)期的任務(wù)。</p>
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<p>在洛倫·威廉姆斯實(shí)驗(yàn)室,研究人員正在使用“創(chuàng)造性破壞”作為蛋白質(zhì)折疊進(jìn)化和創(chuàng)新的模型。這個(gè)詞是由奧地利經(jīng)濟(jì)學(xué)家和政治學(xué)家約瑟夫·熊彼特在20世紀(jì)40年代創(chuàng)造的,它描述了為了開發(fā)一種新的東西,比如智能手機(jī),故意拆除有線電話之類的固定設(shè)備。</p>
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<p>威廉姆斯實(shí)驗(yàn)室(稱為生命起源中心,或COOL。“形成這些結(jié)構(gòu)是一個(gè)非常復(fù)雜的過(guò)程,關(guān)于它們?nèi)绾卧谠缙谶M(jìn)化中出現(xiàn),有很多假設(shè)。”</p>
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<p>與舊同行,與新同行</p>
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<p>Alvarez-Carreño是論文的主要作者,“創(chuàng)造性破壞:舊蛋白質(zhì)的新折疊,”最近在雜志上發(fā)表美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊,或美國(guó)國(guó)家科學(xué)院她和她的合著者(威廉姆斯、羅漢·古普塔和安東·彼得羅夫)挖掘了翻譯機(jī)制中最深的進(jìn)化歷史,翻譯機(jī)制存在于核糖體的所有細(xì)胞中,是所有蛋白質(zhì)的誕生地。</p>
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<p>研究人員提供證據(jù)支持一些最簡(jiǎn)單、最古老和最常見的蛋白質(zhì)折疊的共同起源。它暗示了一種創(chuàng)造性破壞的形式,解釋了簡(jiǎn)單的蛋白質(zhì)折疊如何產(chǎn)生更復(fù)雜的折疊。</p>
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<p>他們發(fā)現(xiàn),一旦一種蛋白質(zhì)能夠折疊并實(shí)現(xiàn)其3D結(jié)構(gòu),當(dāng)它與另一種折疊成不同3D結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)結(jié)合時(shí),這種結(jié)合就很容易成為一種新結(jié)構(gòu)。“因此,從一個(gè)結(jié)構(gòu)到另一個(gè)結(jié)構(gòu)可能不像我們想象的那么難,”威廉姆斯教授說(shuō)化學(xué)與生物化學(xué)學(xué)院“也許這可以解釋我們今天看到的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的多樣性。”</p>
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<p>在熊普特的創(chuàng)造性破壞模型中,開發(fā)“女兒產(chǎn)品”涉及到對(duì)祖先產(chǎn)品的破壞。他們?cè)谡撐闹袑懙溃?amp;ldquo;女兒產(chǎn)品可以繼承祖先的特征,但在本質(zhì)上可以與他們不同。”。在智能手機(jī)的例子中,祖先的有線電話、計(jì)算機(jī)、攝像頭、全球定位和其他技術(shù)被合并以創(chuàng)建一個(gè)女兒,即智能手機(jī)。</p>
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<p>女兒繼承了祖先的許多特征。這些特征在女兒身上以特定的方式相互作用,創(chuàng)造了新的功能壁龕,而這些壁龕在祖先身上是不可能實(shí)現(xiàn)的。</p>
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<p>威廉姆斯說(shuō):“因此,蛋白質(zhì)折疊的創(chuàng)造性破壞可能解釋了我們所看到的許多多樣性。”。</p>
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<p>分子合并</p>
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<p>自從數(shù)十億年前地球上出現(xiàn)最簡(jiǎn)單、最古老的蛋白質(zhì)折疊以來(lái),折疊的數(shù)量已經(jīng)擴(kuò)大,形成了我們?cè)诂F(xiàn)代生物學(xué)中看到的蛋白質(zhì)功能的宇宙。</p>
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<p>但蛋白質(zhì)折疊的起源和進(jìn)化機(jī)制在生物學(xué)中提出了威廉姆斯和他的團(tuán)隊(duì)考慮的核心問(wèn)題。例如,蛋白質(zhì)折疊是如何產(chǎn)生的,是什么導(dǎo)致了當(dāng)代生物系統(tǒng)中蛋白質(zhì)折疊的多樣性,為什么近40億年的折疊進(jìn)化產(chǎn)生的不同折疊少于2000個(gè)?</p>
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<p>研究人員認(rèn)為,創(chuàng)造性破壞可以被普遍化來(lái)解釋這一現(xiàn)象。</p>
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<p>他們解釋說(shuō),在創(chuàng)造性破壞中,一個(gè)開放的閱讀框——編碼蛋白質(zhì)的DNA序列的跨度——與另一個(gè)融合產(chǎn)生一種多肽。合并迫使這兩個(gè)祖先進(jìn)入一個(gè)新的結(jié)構(gòu)。由此產(chǎn)生的多肽可以形成一種獨(dú)立祖先在合并之前無(wú)法獲得的形式。但這些新褶皺并非完全獨(dú)立于舊褶皺。也就是說(shuō),女兒褶皺繼承了祖先褶皺的一些東西。</p>
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<p>廣義地說(shuō),這就是威廉姆斯和他的團(tuán)隊(duì)觀察到的,他們認(rèn)為他們的創(chuàng)造性破壞模型在研究疾病方面有一定的應(yīng)用——蛋白質(zhì)折疊不當(dāng)會(huì)影響細(xì)胞和由這些細(xì)胞組成的人類的健康。</p>
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<p>威廉姆斯說(shuō):“例如,我們認(rèn)為這一過(guò)程在癌癥生物學(xué)中很重要,有很多很多蛋白質(zhì)已經(jīng)融合,而且我們認(rèn)為在癌癥中已經(jīng)發(fā)生了折疊。”。“這是一個(gè)蛋白質(zhì)聚集性疾病的世界,如帕金森氏癥或阿爾茨海默癥,以及沒(méi)有正確折疊或重新折疊的蛋白質(zhì)。”</p>
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<p>但現(xiàn)在,威廉姆斯和他的團(tuán)隊(duì)最感興趣的是他們的創(chuàng)造性破壞模型如何幫助他們理解我們進(jìn)化過(guò)程中最深層的問(wèn)題。</p>
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<p>威廉姆斯說(shuō):“比如,我們從哪里來(lái)。”。“創(chuàng)造性的破壞可以幫助我們了解體內(nèi)蛋白質(zhì)的來(lái)源以及我們是如何成為現(xiàn)在這樣的人的。”</p>
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<p>引用:克勞迪婭·阿爾瓦雷茲·卡雷諾(Claudia Alvarez-Carreño)、羅漢·古普塔(Rohan J.Gupta)、安東·彼得羅夫(Anton S.Petrov)和洛倫·迪恩·威廉姆斯(Loren Dean Williams)。“創(chuàng)造性破壞:新蛋白質(zhì)從舊蛋白質(zhì)折疊。”PNAS期刊</p>
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<p>注:本文由院校官方新聞直譯,僅供參考,不代表指南者留學(xué)態(tài)度觀點(diǎn)。</p>
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